据医学统计不孕不育的原因其中有60%的因素是女方导致的，有30%的因素是男方导致的，另外有10%的原因医学上也查不出来称为不明原因性不孕不育。
一、女性不孕的原因：
1、阴道因素
因阴道闭锁或阴道中隔等先天因素引起性交障碍或困难，从而影响精子进入女方生殖道。再者，由于霉菌、滴虫、淋球菌等感染造成阴道炎症改变了阴道生化环境，降低精子活动力和生存能力，从而影响受孕机会。
2、宫颈因素
宫颈狭窄、息肉、肿瘤、粘连等均可影响精子通过;宫颈糜烂，其炎性渗出物有杀精作用;宫颈粘液中存在抗精子抗体，不利于精子穿透宫颈管或完全使精子失去活动能力，其中值得引起注意的是未婚先孕人工流产后所致的宫颈粘连，尤其是反复人流时更容易造成这一严重合并症，把精子拒之于宫颈口之外。
宫颈管的先天性异常多伴有月经异常或痛经，女孩医院检查。而淋球菌等所致宫颈炎则是通过性生活感染的，常导致宫颈管闭锁或狭窄。
宫颈内口松弛症是引起习惯性晚期流产而致不育的常见原因之一。当妊娠月份增大胎囊重量增加超过宫颈管的承受能力时，颈管扩张，胎囊鼓出并破水，胎儿及胎盘相继排出，常发生在妊娠3个月以后。
3、子宫因素
先天性无子宫、幼稚型子宫及无宫腔的实性子宫等发育不良或畸形都会影响女子的生育能力。子宫后位或严重后屈、子宫内膜炎症、宫腔粘连都是造成不孕的原因。
约75%的子宫内膜异位症患者有不孕史，这是因为它会引起子宫后位粘连，活动差，也可引起输卵管粘连，导致蠕动能力下降;异位的子宫内膜可以作为一个自身抗原，引起妇女免疫机能亢进，如产生抗子宫内膜抗体;异位子宫内膜还可以产生更多的前列腺素，从而导致子宫和输卵管肌肉的强烈收缩，干扰精子与卵子的运行和孕卵的着床，因此造成不孕。
子宫肌瘤是女性最常见的良性肿瘤，子宫肌瘤患者的不孕率可达30-40%，远远高于一般人群的不孕率。其中粘膜下肌瘤可影响精子通行和胚泡的着床，壁间肌瘤不仅影响受孕，还常常引起流产或早产。即使能受孕，到了妊娠晚期，也会因为子宫收缩力的异常而引起早产、阻碍分娩或造成产后大出血。
4、输卵管因素
输卵管过长或狭窄，输卵管炎症引起管腔闭塞、积水或粘连，均会妨碍精子、卵子或受精卵的运行。输卵管疾病可占女性不孕的25%，是不孕的重要原因，造成炎症的疾病包括结核、内膜异位症、滴虫、淋病及其他病原菌感染。阻塞的输卵管可以通过宫腹腔镜、通液、显微外科整形手术获得再通，也可采用“试管婴儿”(体外受精和胚胎移植)技术帮助患者获得妊娠机会。
5、卵巢因素
卵巢内滤泡发育不全、不能排卵并形成*体、卵巢早衰、多囊性卵巢、卵巢肿瘤等影响卵泡发育或卵子排出的因素都会造成不孕。例如，卵泡可以成熟但不能破裂，于是卵子不能排出，其基础体温呈正常双相型，血中激素水平的变化也完全正常，这种病称为卵泡不破裂综合征。
*体功能不全是孕酮分泌不足的表现，其原因多与泌乳素水平过高有关，这时子宫内膜分泌期的发育受到影响从而不利于受精卵着床，即使能着床，也会因孕酮分泌不足而流产。
多囊卵巢综合征以不排卵为特点，它不是一个单独的疾病，而是一系列临床症状及体征的总称，多表现为月经紊乱(月经稀少或闭经);不孕;双侧卵巢增大、包膜增厚、多囊性变;多毛，肥胖，性欲增强。由于内分泌及月经紊乱而造成不孕。
6、内分泌因素
当下丘脑发育成熟不全或下丘脑周期中枢成熟延迟，使下丘脑-垂体-卵巢轴三者之间的调节不完善，于是表现为无排卵月经，闭经或*体功能失调，这些都是不孕症的可能原因。另外，甲状腺机能亢进或低下，肾上腺皮质功能亢进或低下也能影响卵巢功能并阻碍排卵。
7、先天性因素
严重的先天性生殖系统发育不全，这类病人常伴有原发性闭经。性染色体异常，例如特纳氏综合征，真假两性畸形。染色体异常造成的习惯性流产等。
8、全身性因素
营养障碍，代谢性疾病，慢性消耗性疾病，单纯性肥胖等。服用生棉籽油，有*化学试剂，放射线照射，微波等物理因素。
9、精神神经因素
植物性神经系统功能失调，精神病，环境性闭经，神经性厌食，假孕等。
10、其他
免疫性不孕，血型不合(如rh因子或abo溶血造成的习惯性流产或死胎)。
免疫性不孕症约占不孕症患者中的10-30%，其中包含有抗精子抗体，抗子宫内膜抗体，抗卵子抗体，等各类免疫性不孕。而临床上最多见的则为抗精子抗体产生所导致的免疫性不孕。由于女方生殖道炎症，使局部渗出增加，免疫相关细胞进入生殖道，同时生殖道粘膜渗透想改变，增强了精子抗原的吸收，且细菌病*等感染因子又可能作为天然佐剂，增强机体对精子抗原的免疫反应，则生殖道局部及血债中出现抗精子抗体影响精子活力，干扰阻碍受精而导致不孕。
二、男性不育的病因
1、染色体异常
常见的有男性假两性畸形、Klinefelter综合征和XYY综合征，46XY/47XXY等染色体异常致睾丸生精障碍。
2.内分泌疾病
下丘脑功能障碍，如Kallmann综合征，主要是促性腺激素释放激素缺乏;垂体功能障碍，如选择性*体生成素(LH)缺陷症和尿促性素(FSH)缺陷症、高泌乳素血症等。肾上腺皮质增生症可抑制垂体分泌FSH、LH，导致不育。
3.生殖道感染
如前列腺炎、附睾炎、睾丸炎、尿道炎，严重者影响男性的生育能力。
4.输精管道梗阻
先天性和后天性的梗阻均可以影响精子的输送而致不育。
5.睾丸生精功能异常
隐睾、小睾丸、无睾、病*性睾丸炎、精索静脉曲张，*素、磁场、高热和外伤等理化因素皆可引起睾丸生精障碍。
6.精子结构异常和精浆异常
可影响精子的运动、获能和顶体反应等。
7.免疫性不育
男性自身产生的抗精子抗体和女性产生的抗精子抗体均可影响精子活力及对卵子的穿透力。
8.男性性功能障碍
勃起功能障碍、早泄、不射精和逆行射精皆可引起男性不育。
9.药物因素
常见的有西咪替丁、柳氮磺吡啶、雷公藤、螺内酯、呋喃妥因、尼立达唑、秋水仙素、各种激素类药物和癌症化学治疗药物如某些烷基化合物，常能导致暂时或永久的对精子生成的损害。
10.手术因素
如尿道瓣膜手术、尿道梗阻施行的膀胱颈部切开术、腹膜后淋巴结清除术或较大的腹膜后手术，均可能引起逆行射精或射精障碍，导致不育。
11.不良的生活习惯和工作因素
长期穿紧身裤、嗜烟和酗酒、接触有*物质、频繁的热水浴、房事不当或过频、经常长途和过度劳累地骑自行车和放射线损害等。
12.其他
纤毛滞动综合征，表现为病人在儿童时期就患有慢性呼吸道疾病，成年后其精子尾部纤毛异常，精子向前游动的能力弱。